MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Acinetobacter baumannii MDR-TJ plasmid pABTJ1

Total Repeats: 235

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017848	AAC	2	6	26	31	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017848	GTT	2	6	61	66	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017848	CAA	2	6	76	81	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017848	A	8	8	1482	1489	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017848	TTATT	2	10	1501	1510	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017848	TATT	2	8	1524	1531	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017848	TGA	2	6	2168	2173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017848	CCT	2	6	2189	2194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_017848	GCA	2	6	2255	2260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017848	ATCT	2	8	2499	2506	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017848	TTC	2	6	3360	3365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017848	CCT	2	6	4895	4900	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_017848	TAA	2	6	5077	5082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017848	A	6	6	5450	5455	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017848	T	6	6	6083	6088	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017848	ATT	2	6	6889	6894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017848	GAT	2	6	6899	6904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017848	TA	3	6	6907	6912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017848	T	6	6	6914	6919	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017848	AAAT	2	8	6932	6939	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017848	A	6	6	6964	6969	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017848	TAA	2	6	6977	6982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017848	T	6	6	6999	7004	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017848	TTA	2	6	7215	7220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017848	TTGGC	2	10	7223	7232	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_017848	T	7	7	7233	7239	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017848	A	7	7	7248	7254	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017848	AATAA	2	10	7261	7270	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017848	TCTCT	2	10	7610	7619	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
30	NC_017848	AAC	2	6	7684	7689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017848	GTT	2	6	7696	7701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017848	CTC	2	6	8028	8033	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_017848	TAAA	2	8	8088	8095	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017848	AC	3	6	8680	8685	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017848	TAT	2	6	10583	10588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017848	T	7	7	10588	10594	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017848	A	7	7	10595	10601	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017848	AGT	2	6	10620	10625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017848	A	8	8	14155	14162	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017848	TCAA	2	8	14163	14170	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_017848	AC	3	6	15366	15371	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017848	TTGC	2	8	15397	15404	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017848	AAG	2	6	15412	15417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017848	TAA	2	6	15457	15462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017848	TTA	2	6	15476	15481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017848	GA	3	6	15488	15493	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017848	TCAA	2	8	15560	15567	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_017848	ATTT	2	8	15626	15633	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017848	T	6	6	15631	15636	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017848	T	7	7	15777	15783	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017848	TAT	2	6	15788	15793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017848	ATT	2	6	15807	15812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017848	TAA	2	6	15819	15824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017848	T	6	6	16360	16365	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017848	AATG	2	8	16378	16385	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017848	AAC	2	6	16435	16440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017848	TTA	2	6	16459	16464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017848	TTC	2	6	16493	16498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017848	ACCG	2	8	16515	16522	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_017848	T	6	6	16527	16532	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017848	TCTT	2	8	16579	16586	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_017848	ATA	2	6	16649	16654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017848	T	6	6	16665	16670	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017848	AT	3	6	16687	16692	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017848	TA	3	6	16760	16765	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017848	GTT	2	6	16841	16846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017848	TCT	2	6	16860	16865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017848	AG	3	6	16883	16888	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017848	TGC	2	6	16890	16895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017848	TTAT	2	8	16915	16922	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017848	T	6	6	16922	16927	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017848	TGA	2	6	16941	16946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017848	ATT	2	6	16948	16953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017848	CTT	2	6	16956	16961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017848	ATTT	2	8	17039	17046	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017848	TTC	2	6	17169	17174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017848	T	8	8	17227	17234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017848	GCA	2	6	17285	17290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017848	TAT	2	6	17338	17343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017848	AAG	2	6	17365	17370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017848	AATC	2	8	17374	17381	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_017848	TCA	2	6	17388	17393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017848	TTC	2	6	17402	17407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017848	TC	3	6	17461	17466	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_017848	GTG	2	6	17536	17541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017848	CTG	2	6	17572	17577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017848	CTA	2	6	17584	17589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017848	TTG	2	6	17673	17678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017848	A	7	7	17750	17756	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017848	TAA	2	6	17788	17793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017848	T	6	6	17805	17810	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017848	ATG	2	6	17811	17816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017848	ATAG	2	8	17865	17872	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017848	ATG	2	6	17960	17965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017848	ATCT	2	8	18006	18013	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_017848	TCA	2	6	18207	18212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017848	CAATT	2	10	18262	18271	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_017848	AAC	2	6	18283	18288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017848	TA	3	6	18295	18300	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017848	ATC	2	6	18302	18307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017848	T	7	7	18326	18332	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017848	GCT	2	6	18350	18355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017848	TA	3	6	18404	18409	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017848	TAT	3	9	18417	18425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017848	T	6	6	18451	18456	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017848	A	6	6	19259	19264	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017848	T	6	6	19285	19290	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017848	TAA	2	6	19303	19308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017848	ATTG	2	8	19389	19396	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017848	C	6	6	38365	38370	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
111	NC_017848	T	7	7	38732	38738	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017848	TTA	2	6	38743	38748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017848	T	7	7	38752	38758	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017848	A	8	8	39668	39675	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017848	ACAG	2	8	39701	39708	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_017848	TTAC	2	8	39736	39743	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_017848	T	6	6	40168	40173	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017848	CAA	2	6	40186	40191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_017848	T	6	6	40230	40235	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017848	CTAA	2	8	40759	40766	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_017848	AGTAG	2	10	40991	41000	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017848	CT	3	6	41660	41665	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_017848	AT	3	6	41672	41677	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017848	A	6	6	41706	41711	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017848	GCA	2	6	41744	41749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017848	ATT	3	9	43896	43904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017848	GCT	2	6	43931	43936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_017848	ATG	2	6	46710	46715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017848	T	6	6	46810	46815	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017848	TTTA	2	8	46837	46844	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017848	AAC	2	6	47892	47897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017848	A	7	7	47921	47927	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017848	GA	3	6	48417	48422	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017848	T	7	7	54333	54339	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017848	A	6	6	54345	54350	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017848	A	6	6	54352	54357	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017848	ATA	2	6	54361	54366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017848	T	6	6	54367	54372	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017848	TGAT	2	8	54382	54389	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017848	T	6	6	54389	54394	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017848	A	7	7	54419	54425	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017848	AAG	2	6	54438	54443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017848	ATA	2	6	54497	54502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017848	ATT	3	9	54535	54543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017848	ATCA	2	8	54544	54551	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_017848	T	6	6	54678	54683	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017848	GTG	2	6	54735	54740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017848	TG	3	6	54739	54744	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017848	T	8	8	54749	54756	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017848	TTA	2	6	54775	54780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017848	A	6	6	54838	54843	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017848	A	6	6	54891	54896	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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155	NC_017848	A	7	7	55707	55713	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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158	NC_017848	ATAA	2	8	56668	56675	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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160	NC_017848	A	6	6	56685	56690	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_017848	TAAA	3	12	56710	56721	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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171	NC_017848	A	6	6	57218	57223	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.